Varga, János (1991) Adatok Felsőtárkány területének bryofaunájára vonatkozóan Az Eszterházy Károly Tanárképző Főiskola tudományos közleményei (Új sorozat 20. köt.). Tanulmányok a biológiai tudományok köréből = Acta Academiae Paedagogicae Agriensis. Sectio,Biologicae Eger, Eszterházy Károly Tanárképző Főiskola. pp. 81-88. ISSN 2039-1422
Vig, Zsófia, Varga, János (2016) Adatok a Hevesi-sík kisemlősfaunájához gyöngybagoly Tyto alba (Scopoli, 1769), a réti fülesbagoly Asio flammeus (Pontoppidan, 1763) és az erdei fülesbagoly Asio otus (Linnaeus, 1758) bagolyköpet-vizsgálatok alapján Az Eszterházy Károly Egyetem tudományos közleményei (Új sorozat 43. köt.). Tanulmányok a biológiai tudományok köréből = Acta Academiae Agriensis. Sectio Biologiae. pp. 95-107.
Kovács, Zoltán, Varga, János, Dudás, György (2009) Adatok a Kazári Vízvölgy pókfaunájához Az Eszterházy Károly Főiskola tudományos közleményei (Új sorozat 36. köt.). Tanulmányok a biológiai tudományok köréből = Acta Academiae Paedagogicae Agriensis. Sectio biologiae. pp. 67-70. ISSN 1219-4216
Túri, Tünde, Dudás, György, Varga, János (2009) Adatok a Sár-hegy farkaspók (lycosidae) faunájához Az Eszterházy Károly Főiskola tudományos közleményei (Új sorozat 36. köt.). Tanulmányok a biológiai tudományok köréből = Acta Academiae Paedagogicae Agriensis. Sectio biologiae. pp. 77-83. ISSN 1219-4216
Varga, János (2010) Dr. Andrikovics Sándor (1947–2008) Az Eszterházy Károly Főiskola tudományos közleményei (Új sorozat 37. köt.). Tanulmányok a biológiai tudományok köréből = Acta Academiae Agriensis. Sectio Biologiae. pp. 14-15. ISSN 1216-4216
Varga, János (2010) Dr. Bende Sándor (1918–1999) Az Eszterházy Károly Főiskola tudományos közleményei (Új sorozat 37. köt.). Tanulmányok a biológiai tudományok köréből = Acta Academiae Agriensis. Sectio Biologiae. pp. 11-12. ISSN 1216-4216
Varga, János (2010) Dr. Vajon Imre 1929– Az Eszterházy Károly Főiskola tudományos közleményei (Új sorozat 37. köt.). Tanulmányok a biológiai tudományok köréből = Acta Academiae Agriensis. Sectio Biologiae. p. 13. ISSN 1216-4216
Csipkés, Roland, Frisóczki, Bence, Varga, János (2016) Eger város halfaunája Az Eszterházy Károly Egyetem tudományos közleményei (Új sorozat 43. köt.). Tanulmányok a biológiai tudományok köréből = Acta Academiae Agriensis. Sectio Biologiae. pp. 87-94.
Földessy, Mariann, Varga, János (2010) Faunistical and zoogeographical investigation of Heteroptera communities of North-Hungarian medium high mountain ranges Az Eszterházy Károly Főiskola tudományos közleményei (Új sorozat 37. köt.). Tanulmányok a biológiai tudományok köréből = Acta Academiae Agriensis. Sectio Biologiae. pp. 85-92. ISSN 1216-4216
Kiss, Csaba, Varga, János, Stuber, István (2010) A Fővárosi Állat- és Növénykert orangutánjainak (Pongo abelii) mozgásvizsgálata Az Eszterházy Károly Főiskola tudományos közleményei (Új sorozat 37. köt.). Tanulmányok a biológiai tudományok köréből = Acta Academiae Agriensis. Sectio Biologiae. pp. 39-44. ISSN 1216-4216
Dudás, György, Varga, János, Tóth, László, Schmotzer, András (2005) A Hevesi-Sík érzékeny természeti terület bevezetése gerinctelen zoológiai monitorozásának tapasztalatai Az Eszterházy Károly Főiskola tudományos közleményei (Új sorozat 32. köt.). Tanulmányok a biológiai tudományok köréből = Acta Academiae Paedagogicae Agriensis. Sectio Biologiae. pp. 103-113. ISSN 1216-4216
Varga, János, Naár, Zoltán (2004) Hypnum cupressiforme HEDW. Mohafaj mikrogombáinak lehetséges allergén hatásai Az Eszterházy Károly Főiskola tudományos közleményei (Új sorozat 25. köt.). Tanulmányok a biológiai tudományok köréből = Acta Academiae Paedagogicae Agriensis. Sectio Biologiae Eger, Eszterházy Károly Főiskola. pp. 169-174. ISSN 1216-4216
Gyarmathy, István, Korompai, Tamás, Novák, Richárd, Varga, János, Dombos, Miklós (2021) Investigation of insect attraction effect of lamps with different color temperatures Az Eszterházy Károly Egyetem tudományos közleményei (Új sorozat 46. köt.). Tanulmányok a biológiai tudományok köréből = Acta Universitatis de Carolo Eszterházy Nominatae. Sectio Biologiae. pp. 147-156. ISSN 2732-0480
Ötvös, Sándor, Fűköh, Levente, Varga, János (2016) A Kácsi langyos-forrás malakofaunájának vizsgálata Az Eszterházy Károly Egyetem tudományos közleményei (Új sorozat 43. köt.). Tanulmányok a biológiai tudományok köréből = Acta Academiae Agriensis. Sectio Biologiae. pp. 73-85.
Varga, János, Varga, András, Ötvös, Sándor, Fűköh, Levente (2006) A Kácsi-források és a Kácsi-patak csigafaunájának újra vizsgálata Az Eszterházy Károly Főiskola tudományos közleményei (Új sorozat 33. köt.). Tanulmányok a biológiai tudományok köréből = Acta Academiae Paedagogicae Agriensis. Sectio Biologiae. pp. 117-124. ISSN 1216-4216
Varga, János (2013) Köszöntés–Jubilation,megemlékezés Dr. Vajon Imre 85. születésnapja alkalmából Az Eszterházy Károly Főiskola tudományos közleményei (Új sorozat 40. köt.). Tanulmányok a biológiai tudományok köréből = Acta Academiae Agriensis. Sectio Biologiae. pp. 61-68. ISSN 1216-4216
Vig, Zsófia, Horotán, Katalin, Varga, János (2016) Madár és kisemlős adatok az Eszterházy Károly Egyetem Botanikus Kertjéből (Eger) Az Eszterházy Károly Egyetem tudományos közleményei (Új sorozat 43. köt.). Tanulmányok a biológiai tudományok köréből = Acta Academiae Agriensis. Sectio Biologiae. pp. 589-63.
Varga, János, Naár, Zoltán, Kőrösi, Ferenc (2005) Mohából feltárt holyvák (Staphylinidae) nehézfém felhalmozásának elemzése röntgen radiográfiás módszerrel Az Eszterházy Károly Főiskola tudományos közleményei (Új sorozat 32. köt.). Tanulmányok a biológiai tudományok köréből = Acta Academiae Paedagogicae Agriensis. Sectio Biologiae. pp. 198-206. ISSN 1216-4216
Tatár, László, Horotán, Katalin, Varga, János (2021) Necrophag rovarok igazságügyben. Lucilia sericata (Diptera, Calliphoridae) jelentősége a tetemek lebontásának folyamatában Az Eszterházy Károly Egyetem tudományos közleményei (Új sorozat 46. köt.). Tanulmányok a biológiai tudományok köréből = Acta Universitatis de Carolo Eszterházy Nominatae. Sectio Biologiae. pp. 31-50. ISSN 2732-0480
Szendrei, Péter, Dudás, György, Varga, János (2009) Pókfaunisztikai vizsgálatok a kisújszállási Öregerdő területén Az Eszterházy Károly Főiskola tudományos közleményei (Új sorozat 36. köt.). Tanulmányok a biológiai tudományok köréből = Acta Academiae Paedagogicae Agriensis. Sectio biologiae. pp. 71-75. ISSN 1219-4216
Vitéz, Gábor Miklós, Dobos, Anna, Varga, János (2006) Sajólád természeti értékei Az Eszterházy Károly Főiskola tudományos közleményei (Új sorozat 33. köt.). Tanulmányok a biológiai tudományok köréből = Acta Academiae Paedagogicae Agriensis. Sectio Biologiae. pp. 91-102. ISSN 1216-4216
Varga, János (1989) Tájékozódó vizsgálatok különböző stratégiájú mohafajok faunáján Az Egri Tanárképző Főiskola tudományos közleményei (Új sorozat 19/6. köt.). Tanulmányok a biológiai és kémiai tudományok köréből = Acta Academiae Paedagogicae Agriensis. Sectio Biologicae et Chemicae. pp. 59-72. ISSN 0239-1422
Szalóki, Zoltán, Gál, Sándor, Varga, János (2017) A fenntartható fejlődés a nevelésben és az oktatásban Az Eszterházy Károly Egyetem tudományos közleményei (Új sorozat 44. köt.). Tanulmányok a biológiai tudományok köréből = Acta Academiae Agriensis. Sectio Biologiae. pp. 89-102.
Soós, Gergő, Dobos, Anna, Varga, János (2010) A gólyaorr abiotikus tájtényezőinek felvételezése Az Eszterházy Károly Főiskola tudományos közleményei (Új sorozat 37. köt.). Tanulmányok a biológiai tudományok köréből = Acta Academiae Agriensis. Sectio Biologiae. pp. 61-71. ISSN 1216-4216
Soós, Gergő, Varga, János, Dobos, Anna (2010) A gólyaorr biotikus tájtényezőinek felvételezése Az Eszterházy Károly Főiskola tudományos közleményei (Új sorozat 37. köt.). Tanulmányok a biológiai tudományok köréből = Acta Academiae Agriensis. Sectio Biologiae. pp. 73-83. ISSN 1216-4216
Vig, Zsófia, Horotán, Katalin, Varga, János (2017) Élőhelyismeret oktatás és madártani megfigyelés az erdőtelki Arborétumban Az Eszterházy Károly Egyetem tudományos közleményei (Új sorozat 44. köt.). Tanulmányok a biológiai tudományok köréből = Acta Academiae Agriensis. Sectio Biologiae. pp. 133-140.
Varga, János, Horotán, Katalin, Csuzdi, Csaba (2020) A mesterséges megvilágítás hatása a talajfaunára Az Eszterházy Károly Egyetem tudományos közleményei (Új sorozat 45. köt.). Tanulmányok a biológiai tudományok köréből = Acta Universitatis de Carolo Eszterházy Nominatae. Sectio Biologiae. pp. 111-120. ISSN 2732-0480
Varga, János, Korompai, Tamás, Horotán, Katalin, Hirka, Anikó, Gáspár, Csaba, Kozma, Péter, Csóka, György, Csuzdi, Csaba (2022) A répáshutai erdészeti fénycsapda 2014–2019 közötti nagylepkefogásainak elemzése Az Eszterházy Károly Katolikus Egyetem tudományos közleményei (Új sorozat 47. köt.). Tanulmányok a biológiai tudományok köréből = Acta Universitatis de Carolo Eszterházy Nominatae. Sectio Biologiae. pp. 59-75.
Vitéz, Gábor Miklós, Varga, János (2009) A sajóládi erdő zoológiai értékei Az Eszterházy Károly Főiskola tudományos közleményei (Új sorozat 36. köt.). Tanulmányok a biológiai tudományok köréből = Acta Academiae Paedagogicae Agriensis. Sectio biologiae. pp. 77-83. ISSN 1219
Kovács, Dalma, Tóth, László, Rausz, Rita, Antal, Károly, Varga, János (2010) A szalakóta költési eredményei és fészkelőhely választása egy mesterséges odútelepen Az Eszterházy Károly Főiskola tudományos közleményei (Új sorozat 37. köt.). Tanulmányok a biológiai tudományok köréből = Acta Academiae Agriensis. Sectio Biologiae. pp. 31-37. ISSN 1216-4216
Varga, János (2016) Az Eszterházy Károly Egyetem tudományos közleményei (Új sorozat 43. köt.). Tanulmányok a biológiai tudományok köréből = Acta Academiae Agriensis. Sectio Biologiae Eger, Eszterházy Károly Egyetem.
Varga, János (2017) Az Eszterházy Károly Egyetem tudományos közleményei (Új sorozat 44. köt.). Tanulmányok a biológiai tudományok köréből = Acta Academiae Agriensis. Sectio Biologiae Eger, Eszterházy Károly Egyetem.
Varga, János (2020) Az Eszterházy Károly Egyetem tudományos közleményei (Új sorozat 45. köt.). Tanulmányok a biológiai tudományok köréből = Acta Universitatis de Carolo Eszterházy Nominatae. Sectio Biologiae Eger, Eszterházy Károly Egyetem Líceum Kiadó.
Varga, János (2021) Az Eszterházy Károly Egyetem tudományos közleményei (Új sorozat 46. köt.). Tanulmányok a biológiai tudományok köréből = Acta Universitatis de Carolo Eszterházy Nominatae. Sectio Biologiae Eger, Eszterházy Károly Egyetem Líceum Kiadó.
Varga, János (2005) Az Eszterházy Károly Főiskola tudományos közleményei (Új sorozat 32. köt.). Tanulmányok a biológiai tudományok köréből = Acta Academiae Paedagogicae Agriensis. Sectio Biologiae Eger, Eszterházy Károly Főiskola Líceum Kiadó.
Varga, János (2006) Az Eszterházy Károly Főiskola tudományos közleményei (Új sorozat 33. köt.). Tanulmányok a biológiai tudományok köréből = Acta Academiae Paedagogicae Agriensis. Sectio Biologiae Eger, Eszterházy Károly Főiskola Líceum Kiadó.
Varga, János (2009) Az Eszterházy Károly Főiskola tudományos közleményei (Új sorozat 36. köt.). Tanulmányok a biológiai tudományok köréből = Acta Academiae Paedagogicae Agriensis. Sectio biologiae Eger, Eszterházy Károly Főiskola.
Varga, János (2010) Az Eszterházy Károly Főiskola tudományos közleményei (Új sorozat 37. köt.). Tanulmányok a biológiai tudományok köréből = Acta Academiae Agriensis. Sectio Biologiae Eger, Eszterházy Károly Főiskola Líceum Kiadó.
Varga, János, Pénzes-Kónya, Erika (2013) Az Eszterházy Károly Főiskola tudományos közleményei (Új sorozat 40. köt.). Tanulmányok a biológiai tudományok köréből = Acta Academiae Agriensis. Sectio Biologiae Eger, Eszterházy Károly Főiskola Líceum Kiadó.
Varga, János (2009) Veszélyes állatok : Parazita állatok, az ember parazitái, állati eredetű fertőzések (zoonózisok). Eger, Eszterházy Károly Főiskola Líceum Kiadó. ISBN 978-963-9894-42-6
Varga, János (2006) Állatrendszertani gyakorlatok II. Eger, Eszterházy Károly Főiskola Líceum Kiadó.
Varga, János (2002) Állatrendszertani gyakorlatok munkafüzet : Elméleti áttekintés és gyakorlatok. Eger, Eszterházy Károly Főiskola Líceum Kiadó.
Varga, János (2011) Élőhely- és élőlényismeret : Zoológia. Eger, Eszterházy Károly Főiskola Líceum Kiadó. ISBN 978-963-9894-65-5
Varga, János (2017) Különleges, védett állatok = Protected animals In: Természeti és kultúrtörténeti értékek Eger térségében - Natural and cultural heritage in the Eger region. Eger, Eszterházy Károly Egyetem Líceum Kiadó. pp. 97-105.
Varga, János (2015) A környezeti nevelés lehetőségei az állattanban In: Környezeti nevelés és tudatformálás. Eszterházy Károly Főiskola Líceum Kiadó. pp. 235-247.